Cel pracy

Botanika sądowa potrzebuje narzędzi do weryfikacji wartości, jaką materiał pochodzenia roślinnego wnosi do postępowania dochodzeniowego. Biologia molekularna dostarcza technik umożliwiających porównywanie materiału pobranego z miejsca zdarzenia z innym biologicznym materiałem dowodowym. W pracy zaproponowano zestaw siedmiu loci markerów wykorzystujących krótkie powtórzenia tandemowe (STR), służących do profilowania genetycznego dębów (Quercus spp.). Przy ich doborze kierowano się kryterium najwyższej heterozygotyczności stwierdzonej w literaturze. Powodem, dla którego wybrano dęby na przedmiot badań, jest ich rozpowszechnienie na półkuli północnej oraz potrzeba opracowania metody otrzymywania porównywalnych profili genetycznych materiału dochodzeniowego pochodzenia roślinnego.

Materiał i metody

W ramach badania przeprowadzono weryfikację specyficzności starterów względem wybranych gatunków dębu. Przeanalizowano 23 gatunki, w tym większość wcześniej badanych, w kierunku obecności wybranych loci. Po izolacji DNA sekwencje STR zostały poddane amplifikacji przy wykorzystaniu reakcji multipleksowej PCR. Produkty amplifikacji oznaczono metodą elektroforezy kapilarnej. Częstość genotypów obliczono za pomocą testu χ².

Wyniki

Kompletne profile genetyczne uzyskano dla 13 spośród 23 przeanalizowanych gatunków dębu.

Wnioski

Niekompletne profile genetyczne mogą być wynikiem degradacji DNA lub mniejszej homologii w miejscach wiązania starterów. Kompletne profile uzyskano dla większości analizowanych gatunków, jednak otrzymano także niekompletne profile dla gatunków, u których spodziewano się uzyskania pełnych profili. Może to wynikać z utraty jakości DNA na skutek procesów starzenia obejmujących badany materiał roślinny oraz nieodpowiednich warunków jego przechowywania lub metody konserwacji.