Antybiotykoterapia zakażeń układu oddechowego, a zwłaszcza zapaleń płuc, w większości przypadków ma charakter empiryczny i dlatego wymaga jednoczesnego uwzględnienia, poza spektrum działania antybiotyku, wielu innych elementów, takich jak czynniki zmieniające właściwości farmakokinetyczne antybiotyków, schorzenia współistniejące oraz sposób odżywiania. Interakcje antybiotyków z innymi lekami mogą być także przyczyną niepowodzeń w leczeniu zapaleń płuc. Niemniej ważne dla uzyskania właściwego efektu leczniczego wydaje się być odpowiednie kojarzenie antybiotyków, a także unikanie najczęściej powtarzanych błędów terapeutycznych.