Kluczem do zrozumienia patogenezy zapalenia zatok przynosowych jest stan morfologiczno-czynnościowy kompleksu ujściowo-przewodowego. Wieloprzyczynowa niedrożność tego zespołu zaburza drenaż i wentylację zatoki. Powiązania między zmianami zapalnymi w jamie nosowej i zatokach przynosowych oraz oskrzelach potwierdzają teorię o chorobie jednej drogi oddechowej. Nowoczesnym sposobem leczenia operacyjnego w przewlekłym zapaleniu zatok przynosowych jest czynnościowa endoskopowa chirurgia zatok (ang. functional endoscopic sinus surgery, FESS).