Streszczenie
1/2017
vol. 67
Opis przypadku
Zastosowanie techniki massively parallel sequencing (MPS) w analizie ojcostwa – opis przypadku
- Department of Forensic Medicine, Medical University of Warsaw, Poland
- Department of Forensic Medicine, Medical University of Bialystok, Poland
Arch Med Sąd Kryminol 201 7; 67 (1): 61-67
Data publikacji online: 2017/10/02
Cel pracy: W pracy opisano przykład zastosowania techniki MPS (massively parallel sequencing) w celu poszerzenia zakresu analizy spornego ojcostwa.
Materiał i metody: Przy użyciu analizatora genetycznego 3130xl wykonano standardowy test ojcostwa obejmujący 16 markerów autosomalnych. Dodatkowo przeprowadzono badanie zestawem ForenSeq DNA Signature Prep Kit przy użyciu analizatora Illumina MiSeq FGx™ Forensic Genomics System. Obliczenia indeksu ojcostwa (PI) wykonano, stosując program DNAStat v.2.1.
Wyniki: W badaniu 16 markerów autosomalnych ujawniono obecność dwóch niezgodności (D21S11, VWA) dla pary pozwany – dziecko. Na podstawie wyników MPS przeanalizowano wymienione niezgodności, dla pary matka – dziecko ujawniono sekwencję nonconsensus allela 14 locus VWA, u dziecka w locus D3S1358 stwierdzono różnice sekwencji alleli homozygoty 16-16.
Wnioski: Analiza MPS pozwoliła na sformułowanie rozstrzygającego wniosku odnośnie do ojcostwa pozwanego oraz uzyskanie pełnej informacji o polimorfizmie wewnątrzallelicznym.
Materiał i metody: Przy użyciu analizatora genetycznego 3130xl wykonano standardowy test ojcostwa obejmujący 16 markerów autosomalnych. Dodatkowo przeprowadzono badanie zestawem ForenSeq DNA Signature Prep Kit przy użyciu analizatora Illumina MiSeq FGx™ Forensic Genomics System. Obliczenia indeksu ojcostwa (PI) wykonano, stosując program DNAStat v.2.1.
Wyniki: W badaniu 16 markerów autosomalnych ujawniono obecność dwóch niezgodności (D21S11, VWA) dla pary pozwany – dziecko. Na podstawie wyników MPS przeanalizowano wymienione niezgodności, dla pary matka – dziecko ujawniono sekwencję nonconsensus allela 14 locus VWA, u dziecka w locus D3S1358 stwierdzono różnice sekwencji alleli homozygoty 16-16.
Wnioski: Analiza MPS pozwoliła na sformułowanie rozstrzygającego wniosku odnośnie do ojcostwa pozwanego oraz uzyskanie pełnej informacji o polimorfizmie wewnątrzallelicznym.
Słowa kluczowe
DNA, analiza ojcostwa, MiSeq FGx™, polimorfizm wewnątrzalliczny
Zintergrowane z